Le plan d'actions proposé porte sur la recherche d'une meilleure utilisation de l'azote, et non plus uniquement sur la substitution de l'azote minéral par l'azote organique, comme cela avait été fixé. L'objectif de réduction des pertes d'azote passe par son utilisation plus économe. Malgré une tendance à la baisse, ces pertes représentent 1,5 MT d'azote par an. La mission propose de fixer pour 2017 les objectifs ci-après : doubler le rythme de baisse des utilisations d'azote minéral à 3%, réduire les émissions d'ammoniac et de gaz à effets de serre de 10%, réduire les pertes de nitrates dans l'eau de 25 %, augmenter de 50% la production de fertilisants organiques azotés. Le plan détaillé en 11 actions, porte sur : les mesures à prendre pour concrétiser ces gains potentiels, les dispositions réglementaires pour faciliter la mobilisation de l'azote organique, le suivi des pollutions par les nitrates et le suivi des flux d'azote, le développement de filières de traitement des effluents d'élevage, dont la méthanisation, la réduction des pertes d'ammoniac à l'épandage et dans les élevages. Une redevance pollution sur l'azote minéral est une des voies de financement possibles. Des dispositifs complémentaires susceptibles de mobiliser les acteurs de la filière pourraient être recherchés.