La mission a pour objectif de faire émerger un scénario d'aménagement de protection contre les crues des îles de la Barthelasse et de Piot à partir des différentes analyses effectuées par les services de l'Etat et la Ville d'Avignon, maître d'ouvrage du projet d'aménagement. Est finalement approuvé le projet présenté à la mission par la ville d'Avignon, le 27 juin, et adressé parallèlement aux services de l'Etat (scénario 4bis), celui-ci répondant à la demande, consensuelle, formulée le 4 avril 2007 en réunion du comité de pilotage. A titre incident, la mission estime nécessaire de relever la difficulté des acteurs à s'accorder ce qui amène à s'interroger notamment sur l'organisation et la coordination des services de l'État dans un tel cas. Elle relève également la confiance trop absolue dans la modélisation hydraulique, sans suffisamment de recul ni d'analyse de pertinence de ses résultats et de leur réalisme et l'affaiblissement de la DIREN en raison du partage récent de la gestion du « plan Rhône » avec la Compagnie Nationale du Rhône (CNR).